لدى المحللين والإعلاميين مشاكل حول مكتب آية الله خامنئي أو المواد المتعلقة بقيادة الجمهورية الإسلامية.

أحد أسباب صعوبة المحللين ووسائل الإعلام تجاه مكتب آية الله خامنئي أو المواد المتعلقة بقيادة الجمهورية الإسلامية، وأؤكد أن هذا ما يريده أوصياء المكتب أيضًا، هو مساحة مغلقة لمكتب عسكري منفصل. القيادة العامة، ومكتب القيادة ونوابها، ودار نشر كتابات آية الله خامنئي، وحتى فيلق حماية الأوصياء، ومكتب النيابة العامة، والمحكمة الخاصة لرجال الدين. 

وفي الحالة التي ذكرتها، كانت الأجهزة الأمنية القوية حساسة للغاية لتسلل المكتب ورصدت الوضع بشكل منتظم، وقلة من يعرف إمكانية التحقق وحدود صلاحيات المسؤولين. 

لكن آية الله شدد بشدة على التنسيق معه نفسه «في الحالات المتعلقة بالقيادة أو المكتب»، وبالتالي عندما يتم نقل رسالته بواسطة وسطاء معروفين مثل الشيخ محمد محمدي غوربايجاني وسيد علي أصغر حجاز، أو في بعض الحالات سيد علي مقدم وحسين محمدي يكتبها ويعكسها للجمهور بدقة، فمن الواضح، لا يمكن لأي مسؤول في مكتب القيادة المستقلة أن يكون مستقلا ويصدر رأيا يتصل بسلسلة «البيت» ويعتبر رسميا. 

ولكن إذا تم إعادة طبع تغريدات أو تعليقات أشخاص، حتى تلك المتعلقة بالمكتب، على الحسابات الرسمية لآية الله لأن هذه الحسابات تخضع لإشراف صارم ونبلاء سيد مسعود خامنئي، كما أنه متوافق مع والده، فيمكن اعتبارها رأي آية الله.